农民工工资打卡收入达到一定标准需缴纳个人所得税。分析：根据《个人所得税法》，个人工资、薪金所得需缴纳个人所得税，起征点为每月5000元。农民工的工资打卡收入，如果累计超过起征点，就需要依法纳税。此外，如果农民工存在多处收入来源，还需进行年度汇算清缴。提醒：当农民工的工资收入连续多个月超过起征点，且未收到税务部门的纳税通知时，可能表明存在税务合规问题，应及时咨询专业律师或税务顾问。
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具体操作：1. 自行申报：农民工需登录税务部门网站或APP，注册账号，填写个人信息和收入情况，按照系统提示完成申报。注意保留好相关收入证明和纳税凭证。2. 单位代扣代缴：农民工需与用人单位签订代扣代缴协议，由用人单位在发放工资时，按照税务部门规定的税率和计算方法，代扣代缴个人所得税。农民工应定期向用人单位索要纳税证明。3. 年度汇算清缴：如果农民工存在多处收入来源，需在次年3月1日至6月30日期间，登录税务部门网站或APP，进行年度汇算清缴，多退少补。注意及时关注税务部门的通知和政策变化。
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处理方式：从法律角度，农民工工资纳税的常见处理方式包括：1. 自行申报：农民工可通过税务部门网站或APP自行申报纳税。2. 单位代扣代缴：用人单位在发放工资时，可依法代扣代缴个人所得税。选择方式：农民工应根据自身实际情况选择。如果熟悉税务申报流程，可选择自行申报；如果不熟悉或担心出错，可由用人单位代扣代缴。